在比赛进行中,由于我的教练感觉到主裁判判罚不正确,就大声与主裁判理论,结果主裁判判罚我扣分一次,这样的判罚正确吗?

正确。竞赛规则不允许在比赛进行中与裁判争执。比赛后可以申述。